在国家机构中，内阁27名部长中有12名是军人，他们占据了国防安全部、内政部和经济部门的重要职位，在地方政府，军人势力也大举介人。1971年大选后，军人占据了26名省长中的22名。
1969年，271名市长和县长中有147名军人。
到1971 年，这个比例更升至2/3。
另外，军人在国家最高权力机关中也有代表，500名人民代表会议成员中有100名由总统从军队中指定。
西方国家曾有记者报道说：
“群岛之上没有一个村子，不是由中士或上士领导，全国没有一个国有企业，不是由上校或将军担任经理的。”
尚建凯通过前期进入的社会帮派组织，大量收买警察和军队高层，为部队偷渡，武器装备走私进入印尼大开绿灯，用巨额美元开道，很快就控制一个个，大型基地的全部军官后，兵不血刃的控制了各个军事基地，原来的士兵都被解除武装。
全部而换上了自己的人。
然后就以军队的名义，进行军事物资的运输。
利用公司远洋航运强大的运输能力，日夜不停把军事装备和军用物资运到基地，扩建军用机场，扩建兵营。
所有被解除武装的士兵全部实行军事化管理。
全体转变为工程兵，薪水是原来的三倍，比他们原来的待遇好多了，他们当兵也是为了多赚点钱，现在能拿到这么多的薪水，他们还有什么不满足的，因此劳动的积极性高涨，管理十分轻松。
在短短的一个月的时间里，二十万部队全部进入，并控制了二百一十六个重点的军事基地。
由于印尼当局所实行的这些排华政策。
属于一种以血统和文化为基点的，狭隘民族主义政策，从本质上说，是一种彻头彻尾的种族歧视政策。
由于这种排华政策，已上升为政府行为，并在法律上和行政上得到实施，所以给印度尼西亚的华侨华人，造成的伤害就特别严重，印度尼西亚独立后，对华人的歧视和迫害无时不有，无处不在，而且经久不息，一直没有停止过。
针对华人的骚乱和□□。
几乎成了印尼社会一个反复发作的痼疾。
在长达半个世纪的岁月里，印度尼西亚的华人，作为一个曾对印度尼西亚的开拓与发展，作出过杰出贡献的少数民族。
并没有得到他们应该得到的尊重和保护。
印度尼西亚华人的公民权、生存权乃至基本人权受到任意践踏，没有任何保障，印尼社会稍有风吹草动，印尼华人便首当其冲，成为印度尼西亚统治阶级内部各利益集团之间斗争的牺牲品，成为印度尼西亚极端民族主义者发泄不满情绪的替罪羊。
可以说，印度尼西亚华人的命运史上，充满着血泪斑斑的苦难。
印度尼西亚国内的反华势力由来已久。
早在1911年，印度尼西亚“□□教同盟”成立伊始，就公开宣布要改善原住民商人的地位，反对华商，倭国侵略印尼时，蓄意挑拔原住民与华侨之间的种族仇恨。
放纵印尼人大肆抢劫与杀害华侨。
使两族之间关系更加恶化，敌意更深。
1945年到1950年的印度尼西亚民族独立运动期间，印尼人反华情绪不断高涨，不少华侨遭到抢掠屠杀，独立后，掌握了国家政权的印度尼西亚民族政治家视华侨经济力量为“殖民时代的残余”，更以振兴民族经济为由，以激进立法的形式。
从各方面对华侨进行全面的限制和排斥。
在苏加诺时代；印尼政府出台的限制、排斥华侨经济的法案达30个左右，对华商经营的国内贸易、进口企业、汽车商行、碾米业、木材业等加以限制和监督。
并禁止华侨在乡村从事零售业。
特别是苏加诺政府于1959年颁布的第10号总统令，明令从1960年起禁止华侨在印度尼西亚县级以下地区经商。
这道法令被印尼某些地区的军事掌权者，发展为不准华侨在县级以下地区居住，结果造成印度尼西亚50多万华侨失去生计。
有的甚至流离失所，10多万华侨遭遣返。
1965年9月30日印度尼西亚，爆发的“九·三Ｏ”事件中，印尼□□军人集团在消灭印尼**的同时，也对无辜的印尼华侨华人进行了大规模的逮捕和屠戮，苏哈托政府上台后。