与此同时，针对帕弥什病毒的研究从未停止，人们开始研发血清来免疫病毒。
在人类存亡面前，道德也要低头。
在长达三十年的研究之后，世界政府发现研究出来的血清只对极少的部分人有效，大多数人根本无法血清所激发出来的免疫细胞。
免疫计划宣告失败！人类开始逃亡，其实，与其说是反抗，倒不如说是一次看不到希望的垂死挣扎……因为没有人相信那些前往前线的人，还能够活着回来……而反抗本身，其实也不过是人类文明又一次自欺欺人的骗局……
这三十年，后来的人们称为“免疫时代”。]
逃亡时代
史四:[研究虽然失败了，但人类并没放弃，继续向着帕弥什进攻，在人类努力对抗病毒的不久后，世界政府意识到了帕弥什病毒的可怕，帕弥什病毒开始利用人类的工厂主动建造感染体，随着感染体的增多，前线部队根本无法与其对抗，地球防线开始崩溃，世界政府意识到，在这场必败的战争中，逃亡是唯一的选择。
于是，“阿(高)卡(层)狄(逃)亚(跑)计划”被提出！
其实这个计划在免疫时代就已经被人提出，高层的撤退在无时无刻以及悄无声息之中。
“空中花园”就是人类最后的生存之地。
但是，空中花园的容纳有限，这就注定着，筛选开始了......
地球高层开始秘密进行人才和重要人物的输送。
但没过多久，在第五次撤退时政府内部爆发了叛乱，“阿(高)卡(层)狄(逃)亚(跑)计划”遭到暴露，世界一片哗然。
政府的行为无疑宣告着人类的反抗，人们开始绝望。人们变得歇斯底里，地球防守力量几近瓦解。
地球上的各大势力开始放弃抵抗，纷纷开启了自己的撤退计划......
世界政府的空中花园......
九龙的万世铭......
曾贵为“食物链顶端”人类，如今只能从自己造就的怪物手中收回其席卷后的废城……哪怕身为先驱者的多米尼克先生，即使放弃了自己的安逸生活，亲临战火纷飞的前线，也无法拯救已经在悬崖边缘的人类文明哪怕片刻安宁……
幸存者中的权贵开始陆续逃往太空的伊甸花园，而将剩下的人留在所谓的“避难设施”中自生自灭，美其名曰“大撤离，也就是阿卡狄亚计划”
代表资本的政要和财阀，伴随着军队的护送从而相对安全地前往空中花园，所经历的只是目睹地球陷落的短暂后怕;而剩下的平民，哪怕只是孩子，也只能在“避难设施”里抱着至亲和玩偶，等待着几乎是必然到来的死亡……
当然，人类的“人性”似乎在这个时候放出了微光，平民也并非没有机会进入空中花园……
毕竟“人人平等”，不是么?
只不过，你们要付出一些小小的“代价”——而比起和亲人相拥死在所谓的故乡……
这样小小的代价，简直微不足道，不是吗?
随后新人类们把逃离而来的人当做实验品，不断研发制造，终于一一身为“宇宙的精华，万物的灵长”的人类，自然不会接受被未知的，不入流的病毒所打倒。随着人类文明最后的希望“构造体“的研制成功，人类又看到了重返地球的希望。幸存者苟活在“空中花园”上，派出以“构造体”为主要战斗力、“构造体+指挥官”为战术体系的部队，试图从感染体手中夺回地球。
“构造体”在一次又一次的“遣返”中，“意识海”早已丧失了曾属于人类的记忆，只是作为空中花园的指挥者派往地面的忠实兵器而存在着。身为机械同生物相结合的完美结晶，又有着“遣返”、“重启”循环造就下的不死之身。他们没有“生命”的权利，他们仅仅只是工具，仅仅是我们可以任意丢弃的机械。
而我们身为的“指挥官”，也只不过是与“构造体”有“思维信标”所连接的底层操控者，在“空中花园”高层的眼中，同样并无价值。
“反击时代(约2140-)”开始了——
点一场鲜血与欺骗的狂欢，舞一曲人性与堕落的舞蹈，奏一首慷慨与无声的战歌……
“愿每一位重返地球的人类之子平安。”
但如果只有构造体能力强大并没有用，还是需要能够控制局面的指挥官，指挥官就是战局的中心，所以指挥官也要足够强大，为此，空中花园为了培育新一代的指挥官，也是他们夺回地球的棋子，开始了选拔。